دانشگاه تهران مجله تحقیقات دامپزشکی (Journal of Veterinary Research) 2008-2525 74 1 2019 03 21 Immuno-Bioinformatics Study of Autotransporter Protein, Antigen 43, in Enterotoxigenic Escherichia coli Isolated From Calves مطالعه ایمونوبیوانفورماتیک پروتئین اتوترانزپورتر پادگن 43 اشریشیاکلی انتروتوکسیژنیک جدا شده از گوساله 128 141 70250 10.22059/jvr.2018.211721.2504 FA ریحانه قربانپور دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران غلامرضا نیکبخت بروجنی ۱گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران 0000-0002-2970-5827 سید امیر حسین جلالی ۲دانشکده منابع طبیعی دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران 3پژوهشکده زیست فناوری و مهندسی زیستی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران 0000-0003-1381-0865 Journal Article 2018 08 27 <strong>BACKGROUND:</strong> Extensive effort is focused on identifying genomic conserved antigens in development of effective vaccine against Enterotoxigenic <em>Escherichia coli</em>. Antigen 43 is one of the members of a large secreted protein family named autotransporters in the <em>E.coli</em> and other gram negative bacteria. Autotransporter proteins have a similar conserved structure. Some of them are recognized during both experimental and naturally occurring ETEC infections. Antigen 43 is represented as a potential target in vaccine development because of its virulence functions such as cell aggregation, biofilm formation and its presence in convalescent sera from human patients with ETEC diarrhea. <br /><strong>OBJECTIVES:</strong> In this study, we carefully investigate antigenic structure and immunogenicity of the Antigen 43 protein of strain 510 <em>E.coli</em> isolated from calves by experimental methods and immunoinformatics tools. <br /><strong>METHODS:</strong> Amino acid sequence, physico-chemical parameters, stability, secondary and tertiary protein structure, the ability of induction the B and T cell immune responses by having the effective epitopes and also the allergenicity assessment were analyzed. <br /><strong>RESULTS:</strong> In this study, we identified 15 peptide sequences that can potentially induce B and T cell immune responses and finally, 9 of them were introduced as antigens. <br /><strong>CONCLUSIONS: </strong>The results of in-silico analysis on this protein suggested that it can be used in bovine colibacillosis vaccine development. <strong>زمینه مطالعه:</strong> تلاش ها در زمینه تهیه واکسن های کارآمد برای مقابله با <em>ایکولای</em> انتروتوکسیژنیک (ETEC) به سمت شناسایی پادگن های حراست شده ژنومی معطوف شده است. پادگن 43 یکی از اعضای خانواده بزرگ پروتئین‌های ترشحی باکتری <em>ایکولای</em> و سایر باکتری‌های گرم منفی با نام اتوترانزپورترها (ATs) است. پروتئین‌های اتوترانزپورتر ساختمان حراست شده مشابهی دارند و تعدادی از آن‌ها به دنبال عفونت‌های طبیعی و تجربی ETEC شناسایی شده‌اند. پادگن 43 با داشتن خصوصیات حدت‌زای تجمع سلولی و تشکیل بیوفیلم و حضور در سرم انسان‌های مبتلا به اسهال ناشی از ETEC، هدف ارزشمندی در تهیه واکسن محسوب می شود.<br /> <strong>هدف:</strong> در این مطالعه با بهره‌گیری از روش‌های تجربی و ایمونوانفورماتیک به بررسی دقیق ساختار آنتی‌ژنی و ارزیابی ایمنی‌زایی پروتئین پادگن 43 سویه 510 <em>ایکولای</em> ETEC جدا شده از گوساله‌ها پرداختیم.<br /> <strong>روش کار:</strong> توالی اسیدآمینه‌ای، خصوصیات فیزیکی- شیمیایی، پایداری، ساختار دوم و سوم پروتئین و  توانایی بالقوه در ایجاد پاسخ‌های ایمنی سلول‌های B و T با دارا بودن اپی‌توپ‌های مؤثر و خصوصیات آلرژی‌زا بودن آن از جمله شاخص‌های مورد توجه در این پژوهش هستند.<br /> <strong>نتایج:</strong> در این مطالعه 15 قطعه پپتیدی محرک پاسخ یاخته‌های B و T شناسایی شده‌است که تعداد 9 عدد از آن‌ها به‌عنوان پادگن معرفی گردیدند.<br /> <strong>نتیجه</strong><strong>‌</strong><strong>گیری نهایی:</strong> نتایج حاصل از مطالعات مجازی (in-silico) انجام شده روی این پروتئین حاکی از مناسب بودن آن برای تهیه واکسن‌های کلی‌باسیلوز گاو  است.<br />   https://jvr.ut.ac.ir/article_70250_32f6d29a44be8cb180415e7537c4c29b.pdf