تعیین هویت مولکولی و مطالعه شجره شناسی بر اساس ژن ماتریکس (M) ویروس آنفلوانزای پرندگان (H9N2) در ایران بین سالهای 1387- 1377

نویسندگان

1 دانش آموخته دکتری دامپزشکی ، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران ، تهران ، ایران

2 گروه بیماریهای طیور، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران-ایران

3 گروه میکروبیولوژی و ایمنی شناسی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران-ایران

4 گگروه میکروبیولوژی و ایمنی شناسی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران-ایران

5 سازمان دامپزشکی کشور، تهران-ایران

چکیده

زمینه مطالعه: در دهه گذشته موارد متعددی از بیماری آنفلوانزای پرندگان تحت تیپ H9N2 بصورت پانزئوتیک رخ داده و  از سال 1377 موارد متعددی از بیماری آنفلوانزای پرندگان  (تحت تیپ   H9N2 ) در  صنعت طیور ایران گزارش شده است و از آن زمان واکسن کشته  H9N2  برای کنترل بیماری در ایران استفاده شد. هدف: هدف از این مطالعه بررسی تعیین هویت مولکولی و شجره شناسی بر اساس ژن ماتریکس  آنفلوانزای پرندگان  تحت تیپ  H9N2 جدا شده از  گله‌های گوشتی استان تهران از سال1377- 1387  می‌باشد. روش کار: در این مطالعه منطقه کد کننده ژن ماتریکس  هشت  ویروس آنفلوانزای پرندگان H9N2 جداسازی شده از گله‌های  گوشتی استان تهران ازسال 1998 تا2007 به طور کامل تعیین توالی گردید. نتایج: تجزیه و تحلیل حاصل از بررسی  توالی مناطق ژن ماتریکس  ومطالعه  شجره شناسی  ویروس‌های مورد مطالعه بیانگر این است که  توالی ژنی این منطقه از ویروس‌های جداسازی شده در مقایسه با توالی سویه استاندارد که در بانک ژن  وجود دارد، تفاوتی‌هایی را در سطوح مختلف نشان می‌دهد. تجزیه و تحلیل سکانس ژن ماتریکس نشان از جهش‌هایی  در این  ژن می‌باشد. مطالعه شجره شناسی  نشان می‌دهد که این ویروس‌های جداسازی شده مربوط به تحت دودمان G1 می‌باشند. دراین  مطالعه نشان داده شده است که سویه‌های ایران بر اساس این ژن به دو گروه تقسیم گردیده اند. همچنین در این مطالعه نشان داده شده است ژن ماتریکس ویروس‌های H9N2  سویه‌های ایران در بین سال‌های مورد مطالعه بیشترین شباهت را به سویه‌های پاکستان، فلسطین اشغالی و امارت متحده عربی دارد. نتیجه‌گیری‌نهایی: این مطالعه نشان می‌دهد که  ژن ماتریکس سویه‌های در حال گردش در ایران  دچار تغییر شده وحفاظت در مورد این ژن رخ نداده است. نتایج این مطالعه بر  پایش دقیق  و ادامه دار در زمینه بیماری آنفلوانزای  پرندگان در کشور را تأکید می‌کند.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Molecular characterization and phylogenetic study based on matrix gene of avian influenza viruses (H9N2) in Iran during 1998-2008

نویسندگان [English]

  • Vahid Karimi 2
  • Arash Ghalyanchi Langeroudi 3
  • Omid Madadgar 4
  • Hamideh Najafi 3
  • Hosein Maghsoudlo 5
1
2 Department of Poultry Diseases, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran-Iran
3 Department of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran-Iran
4 Department of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran-Iran
5 Iran Veterinary Organization, Tehran-Iran
چکیده [English]

BACKGROUND: H9N2 avian influenza viruses (AIV) A have become panzootic in Eurasia over the last decade and have caused several human infections in Iran since 1998 and inactivated vaccine has been used in chickens to control the disease. OBJECTIVES: The purpose of this study was to analyze H9N2 viruses that have infected broiler in Tehran Province, Iran between 1998 and 2008 based on Matrix gene. METHODS:  The complete coding region of Matrix (M) gene from 8 of H9N2 subtype isolated from chicken flocks in Tehran Province during 1998-2007 was amplified and sequenced. RESULTS: Sequence analysis and phylogenetic studies of H9N2 viruses on the basis of data of viruses in this study and other selected strains available in the GenBank were conducted and determined variations among these sequences at different levels. Sequence analysis revealed a large number of similar substitution mutations and close evolutionary relation among sequences of M gene. Phylogenetic analysis showed that all our isolates belonged to the G1-like sublineage. In this study, it was determined that Iran’s isolates have been in two separate branches and have the most similarity with Pakistan, United Arab Emirate and occupied Palestine’s isolates. CONCLUSIONS: The available evidence indicates that M genes of H9N2 circulating in Iran during the past years were not well conserved. Our finding emphasizes the importance of reinforcing AIV surveillance.
 

کلیدواژه‌ها [English]

  • H9N2
  • matrix gene
  • Phylogenetic study

مراجع

Aamir, U.B., Wernery, U., Ilyushina, N., Webster,
R.G. (2007) Characterization of avian H9N2 influenza
viruses from United Arab Emirates 2000
to 2003. Virology. 361: 45-55.
Alexander, D.J. (2000) A review of avian influenza
in different bird species. Vet Microbiol. 74:
3-13.
Alexander, P.E., De, P., Rave, S. (2009) Is H9N2
avian influenza virus a pandemic potential? Can
J Infect Dis Med Microbiol. 20: e35-6.
Arafa, A.S., Hagag, N., Erfan, A., Mady, W., El-
Husseiny, M., Adel, A., Nasef, S. (2012) Complete
genome characterization of avian influenza
virus subtype H9N2 from a commercial quail
flock in Egypt. Virus Genes. 45: 283-94.
Banks, J., Speidel, E.C., Harris, P.A., Alexander,
D.J. (2000) Phylogenetic analysis of influenza 
A viruses of H9 haemagglutinin subtype. Avian
Pathol. 29: 353-9.
Bashashati, M., Vasfi Marandi, M., Sabouri, F.
(2013) Genetic diversity of early (1998) and recent
(2010) avian influenza H9N2 virus strains
isolated from poultry in Iran. Arch Virol. 158:
2089-100.
Faruqui, F., Mukundan, D. (2010) 2009 pandemic
influenza: a review. Curr Opin Pediatr. 22:
530-5.
Huang, Y., Hu, B., Wen, X., Cao, S., Xu, D.,
Zhang, X., Khan, M.I. (2009) Evolution analysis
of the matrix (M) protein genes of 17 H9N2
chicken influenza viruses isolated in northern
China during 1998-2008. Virus Genes. 38: 398-
403.
Karimi, V., Fard, M.H.B., Shahbazzadeh, D.,
Esmaelizad, M., Pourbakhsh, S.A. (2004). Sequence
analysis and phylogenetic study of hemagglutinin
gene of H9N2 subtype of avian influenza
virus isolated during 1998-2002 in Iran.
Iran Biomed J. 8: 167-172.
Majidzadeh, K., Karimi, V., Soleimanidor, M.,
Estabragh, A.S., Barin, A., Langeroudi, A.G.
(2011) Phylogenetic study on nonstructural (NS)
gene of H9N2 isolated from broilers in Iran during
1998-2007. Pak J Biol Sci. 14: 838-843.
Manzoor, R., Sakoda, Y., Mweene, A., Tsuda, Y.,
Kishida, N., Bai, G.R., Kameyama, K., Isoda, N.,
Soda, K., Naito, M., Kida, H. (2008) Phylogenic
analysis of the M genes of influenza viruses
isolated from free-flying water birds from their
Northern Territory to Hokkaido, Japan. Virus
Genes. 37: 144-52.
Nili, H., Asasi, K. (2003) Avian influenza (H9N2)
outbreak in Iran. Avian Dis. 47: 828-831.
OIE, A. (2012) Manual of Diagnostic Tests and
Vaccines for Terrestrial Animals. Office International
Des Epizooties, Paris, France.
Spackman, E. (2008) Avian Influenza Virus. Humana
Press. (2th ed.) Totowa, NJ, USA.
Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher,
G., Nei, M., Kumar, S. (2011) MEGA5: molecular
evolutionary genetics analysis using
maximum likelihood, evolutionary distance, and
maximum parsimony methods. Mol Biol Evol.
28: 2731-9.
Toroghi, R., Momayez, R. (2006) Biological and
molecular characterization of avian influenza
virus (H9N2) isolates from Iran. Acta Virol. 50:
163-8

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار